৫ম উপজেলা নির্বাচন পরবর্তী অজ্ঞাতনামা অস্ত্রধারী কর্তৃক বাঘাইছড়ি ও বিলাইছড়িতে হত্যার ঘটনায় গভীর উদ্বেগ প্রকাশের পাশাপাশি একটি মহল কর্তৃক বিভিন্ন মিডিয়ায় জেএসএসকে জড়িয়ে মনগড়া, উদ্দেশ্য প্রণোদিত ও প্রতিহিংসামূলকভাবে অভিযোগ করার ঘটনায় সংগঠনটির পক্ষ থেকে প্রতিবাদ জানানো হয়েছে।
জেএসএসের তথ্য ও প্রচার সম্পাদক বিনয় কুমার স্বাক্ষরিত প্রেস বিজ্ঞপ্তিতে জানানো হয়েছে, ঘটনার সুষ্ঠু ও নিরপেক্ষ তদন্ত হওয়ার পূর্বেই এই ঘটনায় মনগড়া ও কাল্পনিকভাবে পার্বত্য চট্টগ্রাম জনসংহতি সমিতিকে দায়ী করে বক্তব্য প্রদান কোনভাবে যুক্তি ও বাস্তবসম্মত হতে পারে না। এ ধরনের বক্তব্য প্রকৃত ঘটনাকে আড়াল করে সুষ্ঠু তদন্তকে যেমনি বাধাগ্রস্ত করবে, তেমনি পার্বত্য চট্টগ্রাম চুক্তি বাস্তবায়নসহ পার্বত্য চট্টগ্রামের রাজনৈতিক পরিস্থিতিকে আরও অস্থিতিশীলতার দিকে ঠেলে দেবে বলে জেএসএস মনে করে। বিবৃতিতে আরো জানানো হয়, পার্বত্য চট্টগ্রাম জনসংহতি সমিতি কোনভাবে উক্ত হামলা ও হত্যাকান্ডের সাথে জড়িত নয়। জনসংহতি সমিতি এ সহিংস ঘটনার তীব্র নিন্দা ও প্রকৃত অপরাধীদের যথাযথ বিচারের দাবি জানায়। জনসংহতি সমিতি উক্ত ঘটনায় নিহত ও আহত ব্যক্তিদের শোক-সন্তপ্ত পরিবারের প্রতি গভীর শোক ও সমবেদনা প্রকাশ করছে এবং আহতদের সুচিকিৎসার ব্যবস্থা গ্রহণের দাবি জানাচ্ছে। একই সাথে এধরনের ঘটনা যাতে পুনরাবৃত্তি না ঘটে তৎ উদ্দেশ্যে এবং পার্বত্য সমস্যার স্থায়ী সমাধান ও এই অঞ্চলে স্থায়ী শান্তি প্রতিষ্ঠার লক্ষে পার্বত্য চট্টগ্রাম চুক্তি যথাযথ ও পূর্ণাঙ্গ বাস্তবায়নের জন্য সরকারের নিকট জোর দাবি জানাচ্ছে।